翁济世见大局已定，及时地建议周垣，“如今我们已经控制汉中平原，仅仅汉中城还在朝廷手里。当务之急，应该尽快将河西走廊骊靬城堡大本营迁至汉中，严防流寇和官军对大本营的偷袭。”
周垣大喜，命宋杰、李过带领两个骑兵团，去骊靬城堡转移大本营，“此行任务艰巨，务必全力以赴。”
宋杰、李过齐声喊道，“保证完成任务，请将军放心。”
二人走后，周垣开始重点关注川陕边界的局势，派侦查员深入陕西四川交界处的崇山峻岭，探查敌情，等待杨鹤以及朱由检的下达作战命令后，以便随时出击。
陕西四川交界处的崇山峻岭之中，因为山高皇帝远，很多地方土匪窝连成片，杀人越货、袭扰州县，历朝历代，都是无可奈何。为了解决匪患，朝廷不得不给大大小小的山寨头领封个官职，企图以暴制暴。若是国家安定，这些山寨头领还能老老实实，一旦政局不稳，这些魑魅魍魉便出来作祟。
明朝从后期开始，土地逐渐地高度集中在各地藩王、大地主，大官僚手里，广大的民众则沦为佃户或者农奴或者流民。小冰河时期天灾，让社会最底层的百姓的日子雪上加霜。贪官污吏的横征暴敛,土豪劣绅的强取豪夺，迫使一无所有的民众唱着《一无所有》背井离乡，寻找安家立命之所。于是，河南、安徽、江西、陕西、甘肃等省的无地农民、逃亡军户、形形色色的罪犯、怀有不臣之心的邪.教头目，陆陆续续的来到川陕边界的深山老林里。或为了谋生，或为了发展教徒。或为了招兵买马，人数达数百万计。
川陕鄂边境地带，山高林密，道路崎岖，虽然有着大片的荒地可以开垦，有大量的山货和奇珍异宝，但是由于土地贫瘠，气候恶劣，加之奸商的盘剥、当地土司头人的勒索，流民的生活依旧极为艰难，很多家庭穷到只有一条像样的裤子，谁出门谁穿。饭就别想能够吃饱，好在可以有足够的野草、野菜可以吃，逢年过节才能够吃上一顿大米。一件衣服穿上十来年，补丁摞补丁，鞋子经常是没有后跟，索性打赤脚。大人小孩的身上，到处爬满了虱子、跳蚤还有其他不知名的小动物。得了病，没有药，命好的可以扛过去，命孬的只有等死。
正当流民们陷入绝望无助之际，白莲教支派混元教乘虚而入，给饥寒交迫的流民们送来了希望，仿佛走在秋风秋雨的暗夜里，忽然看到远处有一盏红灯笼，急慌慌奔了过去。至于是鬼火还是野兽的眼睛，则顾不上了。后世的巫婆神汉、传销分子、保险推销员、诈骗分子的伎俩之所以屡屡得逞，就是利用了人们抓救命稻草的心理。
混元教教徒走乡串户，深入矿山、草地、密林、山村，大肆宣扬“教中所获资财，悉以均分"，"有患相救，有难相死，不持一钱可周行天下"等蛊惑人心的平均互助思想，极大的吸引着处于水深火热之中流民。
大家纷纷加入混元教，希望得到组织的保护。当然组织也不孚众望，带领苦哈哈们和土司、矿主、土豪劣绅作斗争。于是更多的土苦哈哈，“皆受戒约，遂相聚为乱”，“被甲持刀，建旗鸣鼓，往来旁近诸县。发展到顶峰的时候，混元教教徒人数一度达数十万。
旬阳混元教首领刘松，原是被朝廷通缉的要犯和职业赌徒，利用他那个把稻草说成金条的嘴巴，一年时间下来，发展了近万下线。
崇祯三年，晋陕一带以及两广地区、湘鄂边，陆陆续续发生暴乱，大有风雨欲来之势。地方性的武装造反，可以说已经遍及明帝国的角角落落。从东北边陲小镇到雷州半岛，从东海之滨到河西走廊，都造反着的足迹。规模有大有小，小股的绺子有数百人，大规模的绺子有万余人。但这些叛乱多局限于某一地区，有的只限于一个县或几个县。
在炎热的华南地区，其中规模较大的武装叛乱有两处。
在广东潮州，渔霸李文带领手下喽罗，联合山区里的土匪头子，发动武装暴乱，企图割据潮州一带。李文那厮自称铲平王，率领八千多人，据险立寨，有众数万流民争相投靠。铲平王搜集战船一千八百余艘，先后占领了番禺、鹿步、清远大罗山等处，陆续攻打东莞，南海肇庆，翁源等县，敲诈勒索，杀人放火，让广东士绅百姓苦不堪言。
在广西桂平县大藤峡地区，瑶人、壮人土司头人以舜天王蓝贰为首，以打击贪官污吏，严惩豪强地主为名，聚集数万匪徒，以莲花、大藤等寨为据点，向周边大肆扩展，攻州破县，波及两广的高、廉、雷、肇、韶、梧等六府，大肆屠杀普通百姓士绅，队伍发展到万余人。
大藤峡位于黔江中下游的武宣至桂平间，约长百余里，两岸崇山峻岭，江水迅疾。以大藤峡为中心，包括浔州府、梧州府与平乐府西部及柳州府南部的方圆约六百余里地方。明朝遣兵数万围攻大藤峡，叛军退避山谷，借助有利地形，节节抵抗，沿江数百里，出没不定。
极大地牵制了明帝国南方的兵力。满洲鞑子头领皇太极听说两广叛乱后，欣喜若狂。“朱由检的小朝廷，东北有满洲铁骑，北面有蒙古劲旅，西北有闯王高迎祥、老回回马守应的流寇大军，华南有番人造反，可谓是四面楚歌。”
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